序卷一跌打损伤小引看伤有治无治之论秘传下手口诀治周身口诀损伤秘传口诀秘传接骨口诀效方开后秘传要旨总论秘传损方药名十二咏卷二总论卷三跌打水药歌观音针（一点一针）雷火针九龙针太乙救苦针又麻药方附录经验杂方
潘序黄序王序马评汤序马评吴序自序凡例重订凡例卷一痈疽总论部位论名烂溃不敛患孔毒根翻花起肛毒瓦斯攻心阴症门阴疽论阴疽治法流注甲疽井泉疽瘰小肠疽鹤膝风横乳岩贴骨疽骨槽风恶核痰核石疽善头鹅掌风鹅爪风冻疮阴疽
药性赋第一章 寒性药第二章 热性药第三章 温性药第四章 平性药
自序卷之一·治法通论卷之一·调经门经候总论经闭血崩赤白带下白浊白淫卷之二·杂症门上（杂证男女一也。此二卷方论，出女科书，多杂病书所遗，故存之耳。）虚劳客热寒热恶寒中风飞尸血厥螈颤振惊悸颠狂血风烦闷血风
伤寒心境别集
伤寒直格方
卷上胎前恶阻子烦子悬子肿子满子气子喑子痫子淋子嗽子疟心腹痛腰胁痛下血尿血转胞胎气上逼脏躁胎动胎痛孤浆吐血伤寒痢疾泄泻霍乱伤食盅鸣堕胎胎不长鬼胎伤胎肠覃石瘕卷中产后难产胎衣不下血晕厥恶露不下恶露不绝血崩
序自序上集伤寒正名论王叔和辟泥四时论病之谬辟泥日数分经之谬论陶节庵论吴又可诸家编次司天运气分别阴阳十二经离合察脉大法寸口脉论趺阳少阴脉论脉分阴阳死生论仲景六经辨证与内经热病论互异辨中风一辨中风二辨中风
魏序林序自序卷一真中风症中风四言脉诀各症方药中风续论类中风症虚痨虚痨续论脉法方治虚痨不治证卷二咳嗽脉法采《圣济》五脏诸咳嗽痰饮喘促实喘方虚喘方脉息哮症惊悸脉息方药血症脉息喻嘉言龙雷之火论卷三遗精诊法赤
书《玉机微义》后序兰室集·医家十要兰室誓戒戒行吟调鼎吟风火暑湿燥寒发热腹痛头痛腰痛胁痛心痛牙疼眼目泻痢疟（又名）咳嗽吐衄血溺血下血诸气漏淋小水不禁（详淋）喉痹诸疮漏疮疥风癣痔疮疮疝香港脚转筋痿内伤痰饮